土木工程专业以厦门大学建设“世界知名高水平研究型大学”的总体目标为导向，秉承“自强不息，止于至善”校训，弘扬“爱国、革命、自强、科学”精神，培养具有扎实的专业基础知识、良好的人文素养、初步的科学研究能力及一定的国际化视野，获得注册工程师所需理论和实践的基本训练，同时具有强烈的社会责任感、良好的沟通能力和团队协作精神，具有从事土木工程的项目规划、设计、施工和管理能力的高层次创新型应用人才。
土木工程专业毕业生经过5年左右的实际工作锻炼，能成长为工作单位的技术岗位或管理岗位的业务骨干：
1) 具备土木工程师的基本知识、能力和素质。
2) 能在土木工程及相关领域较好地从事设计、施工和管理等工作，或从事相关的科学研究、国际交流等工作。
3) 能在单项工程的设计、施工、管理或科研团队担任负责人或重要角色。
4) 能将施工安全、环境保护、社会、文化和法律等因素融入到土木工程领域的设计、施工、科研和管理过程中，解决复杂土木工程问题。
5) 围绕土木工程及相关领域的新理论、新技术和新方法，不断学习更新知识体系、提升自身能力。
6) 能在工作中发扬科学精神和人文精神，具有高度的社会责任感。